Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHGAP10645 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHGAP10645 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHGAP10645 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHGAP10645 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHGAP10645 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHGAP10645 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHGAP10645 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHGAP10645 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms