Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM10L2AP0DMW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMIM10L2AP0DMW4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms