Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETSIPP0DME0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETSIPP0DME0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms