Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLTBP09497 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLTBP09497 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLTBP09497 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLTBP09497 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLTBP09497 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLTBP09497 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms