Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHCP07864 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHCP07864 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHCP07864 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHCP07864 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LDHCP07864 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LDHCP07864 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LDHCP07864 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LDHCP07864 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LDHCP07864 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LDHCP07864 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LDHCP07864 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms