Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSF1RP07333 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF1RP07333 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms