Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAVP06756 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAVP06756 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms