Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRB1P04280 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRB1P04280 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRB1P04280 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRB1P04280 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRB1P04280 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRB1P04280 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRB1P04280 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRB1P04280 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms