Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD2P04179 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD2P04179 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD2P04179 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD2P04179 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD2P04179 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOD2P04179 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD2P04179 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD2P04179 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms