Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AFPP02771 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AFPP02771 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AFPP02771 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AFPP02771 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AFPP02771 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AFPP02771 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AFPP02771 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms