Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL2A1P02458 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL2A1P02458 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms