Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1RP00736 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1RP00736 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1RP00736 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1RP00736 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1RP00736 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1RP00736 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1RP00736 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms