Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F2P00734 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P00734 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P00734 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P00734 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P00734 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P00734 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F2P00734 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P00734 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F2P00734 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F2P00734 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms