Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EGFRP00533 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EGFRP00533 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EGFRP00533 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EGFRP00533 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EGFRP00533 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EGFRP00533 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EGFRP00533 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EGFRP00533 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms