Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APBA3O96018 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APBA3O96018 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APBA3O96018 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APBA3O96018 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APBA3O96018 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms