Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLDN9O95484 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN9O95484 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms