Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG12O94817 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG12O94817 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms