Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPA1O75762 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms