Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF40O75150 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF40O75150 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF40O75150 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF40O75150 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF40O75150 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF40O75150 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms