Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRD4O60885 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRD4O60885 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRD4O60885 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD4O60885 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD4O60885 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD4O60885 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD4O60885 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRD4O60885 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRD4O60885 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD4O60885 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD4O60885 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD4O60885 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD4O60885 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRD4O60885 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD4O60885 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD4O60885 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRD4O60885 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRD4O60885 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms