Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSCO60682 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSCO60682 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSCO60682 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSCO60682 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSCO60682 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSCO60682 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSCO60682 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSCO60682 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSCO60682 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms