Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY75O60449 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY75O60449 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY75O60449 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LY75O60449 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LY75O60449 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LY75O60449 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LY75O60449 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LY75O60449 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LY75O60449 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LY75O60449 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LY75O60449 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LY75O60449 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
LY75O60449 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY75O60449 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY75O60449 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LY75O60449 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY75O60449 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LY75O60449 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LY75O60449 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms