Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms