Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXTL3O43909 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL3O43909 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms