Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAB2O43741 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKAB2O43741 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms