Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCXO43602 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCXO43602 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCXO43602 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCXO43602 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCXO43602 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCXO43602 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCXO43602 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCXO43602 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCXO43602 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCXO43602 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCXO43602 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCXO43602 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms