Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP290O15078 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP290O15078 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP290O15078 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP290O15078 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP290O15078 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP290O15078 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms