Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNJ2O15056 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms