Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPEF2O14830 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPEF2O14830 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms