Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PODXLO00592 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PODXLO00592 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXLO00592 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PODXLO00592 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PODXLO00592 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms