Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.213e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-209ENST00000449617 1446 ntTSL 213.31□□□□□ -0.283e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-201ENST00000264454 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-210ENST00000450981 721 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-214ENST00000456515 872 ntTSL 37.76□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 MS4A3-205ENST00000526199 394 ntTSL 310.27□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 219.27■□□□□ 0.689e-13■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.279e-13■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 DGKG-205ENST00000447054 295 ntTSL 311.3□□□□□ -0.69e-13■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 46.32□□□□□ -1.49e-13■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SDAD1-204ENST00000502543 650 ntTSL 423.76■■□□□ 1.392e-34■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-212ENST00000490223 1785 ntTSL 222.01■■□□□ 1.112e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-225ENST00000560875 550 ntTSL 421.99■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-205ENST00000557991 578 ntTSL 421.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-206ENST00000422218 588 ntTSL 417.81■□□□□ 0.442e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-216ENST00000559533 889 ntTSL 415.78■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-207ENST00000558634 537 ntTSL 414.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-204ENST00000557878 574 ntTSL 414.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-213ENST00000559438 557 ntTSL 413.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-212ENST00000559308 559 ntTSL 512.4□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-220ENST00000560071 576 ntTSL 511.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RNF31-211ENST00000559275 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-211ENST00000465786 1729 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-203ENST00000412097 562 ntTSL 510.33□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 RPL15-207ENST00000434031 650 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.726e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-204ENST00000504075 501 ntTSL 324.27■■□□□ 1.486e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.046e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.936e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-205ENST00000504639 1766 ntTSL 519.88■□□□□ 0.776e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-207ENST00000511321 706 ntTSL 57.51□□□□□ -1.216e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.246e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PAIP1-210ENST00000515338 726 ntTSL 55.61□□□□□ -1.516e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.573e-19■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 HHEX-204ENST00000551454 1307 ntTSL 1 (best)20.88■□□□□ 0.933e-19■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 PRDX4-201ENST00000379331 852 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.52e-23■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-12■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-16■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-32■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.942e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.631e-11■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 FNBP1L-201ENST00000260506 5341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-11■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 LRRC57-205ENST00000569830 1459 ntTSL 218.33■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 LRRC57-206ENST00000570160 561 ntTSL 414.54□□□□□ -0.085e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-20■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-20■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 MSRB1-203ENST00000473663 373 ntTSL 57.76□□□□□ -1.173e-21■■■■■ 36.1
DDX3XO00571 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 EMC7-204ENST00000532113 607 ntTSL 522.83■■□□□ 1.251e-29■■■■■ 36
DDX3XO00571 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.081e-29■■■■■ 36
DDX3XO00571 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.478e-9■■■■■ 36
DDX3XO00571 UQCRC1-202ENST00000412343 778 ntTSL 321.8■■□□□ 1.087e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 UQCRC1-206ENST00000467690 931 ntTSL 220.09■□□□□ 0.817e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.647e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 UQCRC1-203ENST00000415995 1387 ntTSL 517.04■□□□□ 0.327e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 UQCRC1-205ENST00000463708 739 ntTSL 313.47□□□□□ -0.257e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 FXYD5-205ENST00000423817 892 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-11■■■■■ 36
DDX3XO00571 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 37.46□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.151e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.691e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-212ENST00000533662 1106 ntTSL 225.39■■□□□ 1.661e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.591e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.471e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-203ENST00000524541 495 ntTSL 420.52■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-213ENST00000534725 935 ntTSL 220.39■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-204ENST00000526338 655 ntTSL 316.64■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 36
DDX3XO00571 SLC52A2-210ENST00000532815 513 ntTSL 413.93□□□□□ -0.189e-12■■■■■ 36
DDX3XO00571 RPS19BP1-203ENST00000459956 852 ntTSL 221.26■□□□□ 0.992e-11■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 RPS19BP1-202ENST00000420879 861 ntTSL 219.7■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 RPS19BP1-204ENST00000472291 869 ntTSL 218.41■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 RPS19BP1-206ENST00000491966 647 ntTSL 215.12■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.412e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.782e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-7■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.019e-7■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 PQLC2-205ENST00000469076 1512 ntTSL 220.83■□□□□ 0.929e-7■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.12□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.871e-29■■■■■ 35.9
DDX3XO00571 BCAP31-206ENST00000442093 793 ntTSL 223.62■■□□□ 1.371e-29■■■■■ 35.9
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