Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DFFAO00273 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DFFAO00273 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DFFAO00273 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DFFAO00273 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DFFAO00273 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DFFAO00273 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DFFAO00273 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms