Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BQV1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BQV1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BQV1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BQV1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BQV1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BQV1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BQV1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BQV1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BQV1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BQV1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms