Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA8SH3BPF8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA8SH3BPF8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms