Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNRNPCL3B7ZW38 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms