Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP27XA6NNY8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP27XA6NNY8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP27XA6NNY8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP27XA6NNY8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms