Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL1A6NKG5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL1A6NKG5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms