Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCNX2A6NKB5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms