Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGPEP1LA6NFU8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGPEP1LA6NFU8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms