Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms