Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37CA5D8V6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms