Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF804BA4D1E1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF804BA4D1E1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms