Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FRMD3A2A2Y4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FRMD3A2A2Y4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms