Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLRN2A0PK11 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLRN2A0PK11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms