Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA3Q9Y6H8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA3Q9Y6H8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms