Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD2APQ9Y5K6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD2APQ9Y5K6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms