Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRRAPQ9Y4A5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRRAPQ9Y4A5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms