Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KIF3AQ9Y496 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms