Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP3Q9Y3E7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP3Q9Y3E7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms