Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
TRAPPC8Q9Y2L5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms